Ecologia e Biologia Evolutiva – LEBio

Apresentação

O Laboratório de Ecologia & Biologia Evolutiva (LEBio) faz parte do Instituto de Biociências da Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (INBIO/UFMS) e tem como principal objetivo auxiliar estudos com populações naturais de diferentes grupos taxonômicos através da análise de marcadores moleculares e sequenciamento de DNA.

Projetos desenvolvidos:

– Avaliação de cepas bacterianas para promoção de crescimento em três cultivares de algodão (CPAN/UFMS)

– Diversidade, reprodução e desenvolvimento de abelhas solitárias e sociais no Cerrado e Pantanal de Mato Grosso do Sul

– Diversidade de liquens de altas montanhas: uma abordagem molecular

– DNA barcoding de liquens foliosos do Cerrado

– Estrutura filogeográfica de leguminosas arbóreas do Cerrado-Pantanal

– Estrutura genética de populações e filogeografia de bromélias do Mato Grosso do Sul, Brasil

– Evolução e dispersão de espécies antárticas de fungos liquenizados

– Genética da conservação de cactáceas endêmicas do Pantanal Sul

– Implantação da Coleção de Bactérias Promotoras de Crescimento Vegetal do Pantanal e Cerrado Sul Mato-Grossense (CPAN/UFMS)

– Microbioma plantas e fungos liquenizados de Mato Grosso do Sul: potencial biotecnológico, desafios e perspectivas diante da perda de biodiversidade

– UFMS Composta

 

Linhas de pesquisa:

Biologia e Genética de Abelhas

Genética, Evolução e Conservação de Plantas e Fungos liquenizados

Microbiologia Ambiental

Taxonomia Molecular de Plantas e Fungos liquenizados

 

Grupos de pesquisa CNPq:

Genética e Evolução de Plantas do Sistema Cerrado-Pantanal-Chaco (UFMS)

Genética Vegetal (UFRGS)

Liquenologia (UFMS)

Microbiologia Aplicada (UFMS)

 

Equipe:

Docente responsável E-mail Ramal
Juliano de Carvalho Cury juliano.cury@ufms.br 7013
http://lattes.cnpq.br/6286838179330044
Docentes associados
Aline Pedroso Lorenz alineplorenz@ufms.br
http://lattes.cnpq.br/3847687662785649
Gecele Matos Paggi gecele.paggi@ufms.br
http://lattes.cnpq.br/3647657888525208
Rodrigo Pires Dallacqua rodrigo.dallacqua@ufms.br 7547
http://lattes.cnpq.br/8347245521292709
Técnica responsável E-mail Ramal
Josiane Vogel Cortina Theodoro josiane.theodoro@ufms.br 7013
http://lattes.cnpq.br/9355541021021839

 

Pesquisadores Colaboradores

Adriano Afonso Spielmann (INBIO/UFMS)

Andressa Silva Rodrigues (CPCS/UFMS)

Clarisse Palma Silva (Unicamp)

Denise Brentan da Silva (FACFAN/UFMS)

Fernanda Bered (UFRGS)

Flávio Macedo Alves (INBIO/UFMS)

Luciana da Silva Canez (INBIO/UFMS)

Marivaine da Silva Brasil (CPAN/UFMS)

Nayara Fernanda Lisbôa Garcia (CPAN/UFMS)

Wellington Santos Fava (FAMED/UFMS)

 

Estudantes de Pós-graduação:

Brenda S. Tomichá de Oliveira (PPG Biotecnologia – UFMS)

Daniel Guerra Franco (PPG Ecologia e Conservação – UFMS)

Rosana Alessandra Segatto (PPG Biotecnologia – UFMS)

Thianny Fernanda Carrelo Viana (PPG Biotecnologia e Biodiversidade – UFMS)

Victor Borges Rezende (PPG Ecologia e Conservação – UFMS)

 

Estudantes de graduação:

 

Horário de atendimento:

Segunda a sexta-feira das 7 às 11h e das 13 às 17h.

 

REDES SOCIAIS

Página do Faebook: https://www.facebook.com/LabEcoBioEvol

Instagram: https://www.instagram.com/labecolbioevol/

Twitter: @LebioPc

 

Lista de equipamentos:

– Agitador magnético com aquecimento até 20L, modelo AGM20AQ (Arsec)
– Agitador mecânico tipo vórtex, modelo K45-2820 (Kasvi)
– Autoclave modelo horizontal de bancada, modelo AB-21 (Phoenix Luferco)
– Balança analítica eletrônica, modelo AS 220 C/2 (Radwag)
– Banho-maria com aquecimento até 100ºC, modelo NT245 (Nova Técnica)
– Banho-maria com aquecimento até 60ºC, modelo STERN 6 (Sieger)
– Cabine de fluxo laminar, modelo CFLV – 12 (Veco)
– Cabine de segurança biológica, modelo PA400 ECO (Pachane)
– Capela de exaustão de gases em fibra de vidro, modelo LCE-05 (Lutech)
– Centrífuga para microtubos, modelo 5418 (Eppendorf)
– Centrífuga refrigerada para microtubos e placas, modelo 5804R (Eppendorf)
– Cuba de eletroforese horizontal 14 x 14 cm
– Cuba de eletroforese horizontal 17 x 17 cm
– E-Gel Power Snap Electrophoresis Device (ThermoFisher)
– Espectrofotômetro para ácidos nucleicos, modelo NanoDrop®2000 (ThermoFisher)
– Estereomicroscópio, modelo SMZ645 (NIKON)
– Estufa de secagem e esterilização, modelo MD 1.6 (Medicate)
– Fonte de eletroforese, modelo 300SDT (GSR)
– Fonte de eletroforese, modelo K33-300V (Kasvi)
– Freezer Vertical, 246L,  modelo CVU30 (Consul)
– Freezer Vertical, 246L, modelo CVU30 (Consul)
– Freezer Vertical, 577L, modelo GPC- 57 (Gelopar)
– GPS, modelo eTrex30 (Garmin)
– Microcentrífuga para spin, modelo MiniStar
– Microondas, 18L, modelo MEF- 28 (Electrolux)
– Microscópio, modelo cx22 led (Olympus)
– Moinho de bolas oscilantes (macerador), modelo MM400 (Retsch)
– pHmetro de bancada digital; modelo pHB500 (Ion)
– Refrigerador duplex, 142L e 316L,  modelo RDV48 (Continental)
– Sequenciador de ácidos nucleicos Gene Studio S5, com Ion Chef System 5 (ThermoFisher)
– Termobloco, até 150ºC, modelo Accublock (Labnet)
– Termociclador com gradiente de temperatura, modelo Mastercycler gradient 96 (Eppendorf)
– Termociclador com gradiente de temperatura, modelo Veriti 96 Well Thermal Cycler (Applied Biosystems)
– Thermo mixer modelo Thermomixer C marca: Eppendorf
– Transiluminador modelo Enduro UV. 302nm; marca Labnet

 

Agendamentos:

Sequenciador Gene Studio S5

https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/A38194

Contato: juliano.cury@ufms.br

 

Espectrofotômetro NanoDrop 2000

https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/ND-2000

Horários disponíveis em: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1pKuBu62N85HbzyhnrtEqhETF7lQuLlXduhW93-IqEE8/edit?usp=sharing

Contato: josiane.theodoro@ufms.br ou (67) 3345-7013

 

Termociclador Veriti

https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/4375305

Compatível com microtubos de 0,2 ml, strips, placas de 96 poços.

Horários disponíveis em: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1SBGJ0t3WvNCjU-sqQQCR9L0iiG-Da42wPlTd-Y3_Gj0/edit?usp=sharing

Contato: josiane.theodoro@ufms.br ou (67) 3345-7013

 

Termociclador Eppendorf 5331 MasterCycler Gradient

Compatível com microtubos de 0,5 ml, 0,2 ml, strips, placas de 96 poços.

Horários disponíveis em: https://docs.google.com/spreadsheets/d/19IifJB5QGAJpyQIg4LcFrUPghsisO70U-3sbhwJFBKM/edit?usp=sharing

Contato: josiane.theodoro@ufms.br ou (67) 3345-7013

 

Autoclave Horizontal de bancada Phoenix Luferco AB-21

Horários disponíveis em: https://docs.google.com/spreadsheets/d/1a6bfeLMq5LwC3vvghJdDCC9cvQMcv6wEhttozHBqGkM/edit?usp=sharing

Contato: josiane.theodoro@ufms.br ou (67) 3345-7013

 

Endereço:
Laboratório de Ecologia e Biologia Evolutiva
Instituto de Biociências
Universidade Federal de Mato Grosso do Sul
Avenida Costa e Silva s/n, Bairro Universitário, Cidade Universitária

 

Publicações (2018-2022)

2018

 

Godoy FMR, Lenzi M, Ferreira BHS, Vicente-Silva L, Zanella CM, Paggi GM. 2018. High genetic diversity and moderate genetic structure in the self-incompatible, clonal Bromelia hieronymi (Bromeliaceae). Botanical Journal of the Linnean Society, 187(4): 672-688. doi: 10.1093/botlinnean/boy037.

Gumboski EL, Eliasaro S, Scur MC, Lorenz-Lemke AP, Borges da Silveira RM. 2018. A new riparian species of Ramalina (Ramalinaceae) from Brazil, with a key to neotropical saxicolous species. Lichenologist, 50: 541-553.

Hartfelder K, Tiberio GJ, Lago DC, Dallacqua RP, Bitondi MMG, Gentile-Bitondi MM. 2018. The ovary and its genes-developmental processes underlying the establishment and function of a highly divergent reproductive system in the female castes of the honey bee, Apis mellifera. Apidologie, v. 49, p. 49-70, 2018.

Kitaura MJ, Scur MC, Spielmann AA, Lorenz-Lemke AP. 2018. A revision of Leptogium (Collemataceae, lichenized Ascomycota) from Antarctica with a key to species. Lichenologist, 50: 467-485.

Kitaura MJ, Scur MC, Valerio Junior C, Lorenz AP. 2018. Massalongia patagonica (Massalongiaceae, Ascomycota lichenised), a new species from southern South America. Sydowia, 70: 211-286.

Oliveira JL, Cury JC, Gurgel-Gonçalves R, Bahia AC, Monteiro FA. 2018. Field-collected Triatoma sordida from central Brazil display high microbiota diversity that varies with regard to developmental stage and intestinal segmentation. PLoS Neglected Tropical Diseases, 12: e0006709.

Sena Da Silva IH, Duarte da Costa VH, Cury JC, Valicente FH, Polanczyk RA. 2018. The infectivity of SfMNPV on fall armyworm is influenced by the host plant. Revista Brasileira De Milho E Sorgo (Online), 17: 369.

Todeschini CC, Parizotto JLB, Guzman F, Zanella CM, Margis R, Goetze M, Paggi GM, Costa LMS, Aguiar-Melo C, Hirsch LD, Bered F. 2018. Development, characterization, and transferability of SSR markers for Vriesea carinata (Bromeliaceae) based on RNA sequencing. Applications in Plant Sciences, 6(10): e1184. doi: 10.1002/aps3.1184.

Versieux LM, Coffani-Nunes JV, Paggi GM, Costa AF. 2018. Check-list of Bromeliaceae from Mato Grosso do Sul, Brazil. Iheringia, Série Botânica, 73(supl.): 163-168. doi: 10.21826/2446-8231201873s163.

Zenk FL, Firmer C, Wöhrmann T, Vicente-Silva L, Weising K, Huettel B, Paggi GM. 2018. Development of 15 nuclear microsatellite markers in Deuterocohnia (Pitcairnioideae; Bromeliaceae) using 454 pyrosequencing. Applications in Plant Sciences, 6(4): e1147. doi: 10.1002/aps3.1147.

2019

Fava WS, Cunha NL, Lorenz AP. 2019. Reproductive phenology of Leptolobium dasycarpum and L. elegans (Leguminosae, Papilionoideae) across the Brazilian savanna based on herbarium records. Flora, 254: 34-41.

Fava WS, Gomes VGN, Lorenz AP, Paggi GM. 2019. Cross‑amplification of microsatellite loci in the cacti species from Brazilian Chaco. Molecular Biology Reports, 47: 1535-1542. doi: 10.1007/s11033-019-05064-3.

Godoy FMR, Paggi GM, Palma-Silva C. 2019. Cross‑amplification of nuclear microsatellite markers in Aechmea distichantha Lem. (Bromeliaceae). Brazilian Journal of Botany, 42: 353-359. doi: 10.1007/s40415-019-00528-z.

Kitaura MJ, Bernardo C, Mossmann NK, Rodrigues AS, Pineda JMET, Barbosa TD, Canez LS, Spielmann AA, Honda NK, Fleig M, Lorenz AP. 2019. Leptogium (Collemataceae, Peltigerales) from Mato Grosso do Sul state, Brazil: nine new records, three new taxa and a key for the species. Phytotaxa (on-line), 399: 127.

Kitaura MJ, Costa PC, Scur MC, Lorenz AP. 2019. Genetic and morphological variations of the lichenized fungus Steinera intricata (Arctomiaceae, Lecanoromycetes) from southern South America to Antarctic Peninsula. Polar Biology, 42: 907-918.

Tomas W, Roque FO, Medici P, Chiaravalloti R, Tortato F, Penha J, Izzo T, Garcia LC, Lourival R, Girard P, Albuquerque NR, Almeida-Gomes M, Andrade MH, Araujo F, Araujo A, Arruda E, Assuncao V, Battirola L, Benites M, Boock J, Bortolotto IM, Brasil MS, Camilo A, Campos Z, Carniello M, Catella A, Cheida C, Crawshaw PG, Crispim SM, Damasceno-Júnior GA, Desbiez A, Dias F, Eaton D, Faggioni GP, Farinaccio MA, Fernandes JF, Ferreira V, Fischer E, Fragoso C, Freitas GO, Galvani F, Garcia A, Garcia C, Graciolli G, Guariento RD, Guedes N, Guerra A, Herrera  H, Hoogesteijn R, Ikeda S, Juliano R, Kantek D, Keuroghlian A, Lacerda AC, Lacerda A, Landeiro VL, Laps RR, Layme V, Leimgruber P, Rocha F, Mamede S, Marques D, Marques M, Mateus L, Moraes R, Moreira T, Mourao GM, Nicola R, Nogueira D, Nunes A, Nunes Da Cunha C, Oliveira M, Oliveira M, Paggi GM, Pellegrin A, Marcel G, Pinho J, Pinto J, Pott A, Provete D, Dos Reis V, Rei, LK, Renaud P-C, Ribeiro D, Rossetto O, Sabino J, Rumiz D, Salis SM, Santana D, Santos AS, Sartori ALB, Sato M, Schuchman K-L, Scremin-Dias E, Seixas G, Severo-Neto F, Sigrist MR, Silva A, Silva C, Siqueira A, Soriano B, Sousa L, Souza F, Strussmann C, Sugai LS, Tocantins N, Urbanetz C, Valente-Neto F, Viana D, Yanosky A, Junk W. 2019. Sustainability agenda for the Pantanal wetland: perspectives for a collaborative interface among science, policy, and decision-making. Tropical Conservation Science, 12: 1-30. doi: 10.1177/1940082919872634.

2020

Büttow MV, Goetze M, Pinheiro FG, Paggi GM, Zanella CM, Bered F. 2020. Reproductive success of Aechmea winkleri, a clonal and self-incompatible bromeliad from the Atlantic rainforest. Flora, 262: 151521. doi: 10.1016/J.Flora.2019.151521.

Costa CP, Machado CAS, Santiago WMS, Dallacqua RP, Garófalo CA, Francoy TM. 2020. Biome variation, not distance between populations, explains morphological variability in the orchid bee Eulaema nigrita (Hymenoptera, Apidae, Euglossini). Apidologie, v. 51, p. 984-996.

Costa RB, Moraes PM, Skowronski L, Oliveira CE, Nogueira ML, Yui RMS, Lorenz AP, Fava WS. 2020. Genetic diversity and population structure of Croton urucurana Baill. (Euphorbiaceae) in Central Brazil by ISSR markers. Brazilian Journal of Botany, 43: 831-838.

Fava WS, Costa PC, Lorenz AP. 2020. Ecological niche modelling and genetic analyses reveal lack of geographic differentiation of Leptolobium dasycarpum (Leguminosae, Papilionoideae) across the Brazilian savannah. Flora, 264: 151566.

Gomes AC, Ferreira BHS, Souza CS, Arakaki LMM, Aoki C, Paggi GM, Sigrist MR. 2020. Adaptive response of extreme epiphyte Tillandsia species (Bromeliaceae) is demonstrated by different sexual reproduction strategies in the Brazilian Chaco. Botanical Journal of the Linnean Society, 192(4): 840-854. doi: 10.1093/botlinnean/boz104.

Kitaura MJ, Scur MC, Theodoro JVC, Piovezan-Borges AC, Lorenz AP. 2020. Hondaria, a new genus of Collemataceae (Ascomycota lichenized) from South America. Acta Botanica Brasilica, 34: 615-622.

Lago DC, Martins JR, Dallacqua RP, Santos DE, Bitondi MMG, Hartfelder K. 2020 Testis development and spermatogenesis in drones of the honey bee, Apis mellifera L.. Apidologie, v. 51, p. 935-955.

Lenzi M, Paggi GM. 2020. Reproductive biology of Dyckia excelsa Leme (Bromeliaceae): a xerophyte species from ironstone outcrops in central-western Brazil. Plant Species Biology, 35: 97-108. doi: 10.1111/1442-1984.12261.

Ruas RB, Paggi GM, Aguiar-Melo C, Hirsch LD, Bered F. 2020. Strong genetic structure in Dyckia excelsa (Bromeliaceae), an endangered species found on ironstone outcrops in Pantanal, Brazil. Botanical Journal of the Linnean Society, 192: 691-705.

Viana TFC, Campelo APS, Baldani JI, Fernandes-Júnior PI, Baldani VLD, Silva WM, Paggi GM, Brasil MS. 2020. Cultivable bacterial diversity associated with bromeliad roots from ironstone outcrops in central Brazil. Brazilian Journal of Biology, 80(4): 872-880. doi: 10.1590/1519-6984.224982.

2021

Botelho TSG, Paggi GM, Farinaccio MA. 2021. Genetic diversity and fragmentation of Aspidosperma quebracho-blanco (Apocynaceae) natural habitats, conservation issues in chaco forest and savanna biomes. Darwiniana, nueva serie, 9(1): 115-129. doi: 10.14522/darwiniana.2021.91.932.

Fava WS, Godoy FMR, Zanella CM, Aguiar-Melo C, Farinaccio MA, Bered F, Palma-Silva C, Paggi GM. 2021. Diversidade Genética e Padrões Filogeográficos de Plantas do Chaco. In: Sartori ALB, Souza PR, Arruda RCO, Sinani TRF (Org.). Chaco: caracterização, riqueza, diversidade, recursos e interações. 1ed. Campo Grande: Editora UFMS, p. 222-248.

Galeano RMS, Godoy FMR, Duré LMM, Fernandes‑Júnior PI, Baldani JI, Paggi GM, Zanoelo FF, Brasil MS. 2021. Potential of Bacterial Strains Isolated from Ironstone Outcrops Bromeliads to Promote Plant Growth Under Drought Conditions. Current Microbiology, 78: 2741-2752. doi: 10.1007/s00284-021-02540-7.

Jurelevicius D, Pereira, RS, Mota FF, Cury JC, Oliveira IC, Rosado AS, Mason OU, Jansson JK, Seldin L. 2021. Metagenomic analysis of microbial communities across a transect from low to highly hydrocarbon-contaminated soils in King George Island, Maritime Antarctica. Geobiology, 20: 98-111. doi: 10.1111/gbi.12472.

Menezes J, Cury JC, Souza LM. 2021. Sustainable Practices Improving the University Campus: Feasibility of A Photovoltaic System. Journal of Chemistry, Environmental Sciences and its Applications, 7: 43-53.

Lagostina E, Andreev M, Dal Grande F, Grewe F, Lorenz AP, Lumbsch T, Rozzi R, Ruprecht U, Sancho LG, Søchting U, Scur M, Wirtz N, Printzen C. 2021. Effects of dispersal strategy and migration history on genetic diversity and population structure of Antarctic lichens. Journal of Biogeography, 48:1635-1653. doi: 10.1111/jbi.14101.

Paggi GM, Palma-Silva C, Bered F. 2021. Pollination by hummingbirds of Vriesea gigantea Gaudich. (Bromeliaceae) populations in Southern Brazil. Rodriguésia, 72: e01392019. doi: 10.1590/2175-7860202172056.

Pineda JMT, Barbosa TD, Kitaura MJ, Spielmann AA, Lorenz AP. 2021. Two new species of Sticta (Peltigeraceae subfam. Lobarioideae) from the Brazilian Cerrado (Brazilian savanna). The Bryologist, 124(4): 506-521.

Rodrigues AS, Canez LS, Lorenz AP. 2021. Canoparmelia amazonica, Myelochroa lindmanii and Parmelinella salacinifera belong to Parmelinella (Parmeliaceae). The Bryologist, 124: 352-361.

Scur MC, Kitaura MJ, Paula JB, Spielmann AA, Lorenz AP. 2021. Contrasting variation patterns in Austroplaca hookeri and Rusavskia elegans (Teloschistaceae, lichenized Ascomycota) in maritime Antarctica. Polar Biology, 45: 101-111.

Spielmann AA, Scur MC, Lorenz AP, Honda NK. 2021. The rediscovery of Xanthoria (Teloschistaceae) in Brazil. Archive for Lichenology, 24: 1-2.

Vicente-Silva L, Godoy FMR, Faggioni GP, Lorenz AP, Paggi GM. 2021. Patchily distributed but not necessarily isolated populations of Deuterocohnia meziana: a threatened bromeliad from rock outcrops. Botanical Journal of the Linnean Society, boab087, doi: 10.1093/botlinnean/boab087.

Vicente-Silva L, Godoy FMR, Faggioni GP, Lorenz AP, Paggi GM. 2021. Patchily distributed but not necessarily isolated populations of Deuterocohnia meziana: a threatened bromeliad from rock outcrops. Botanical Journal of the Linnean Society, boab087, doi: 10.1093/botlinnean/boab087.

2022

 

Galeano RMS, Godoy FMR, Duré LMM, Fernandes‐Júnior PI, Baldani JI, Paggi GM, Zanoelo FF, Brasil MS. 2022. Characterization of bacterial strains for plant growth promotion under drought conditions isolated from bromeliads roots from ironstone outcrops in central Brazil. Biologia. No prelo.

Kitaura MJ, Torres J, Scur MC, Lorenz AP, Faria RR. 2022. New species and new records of Peltula (Lichinales, Ascomycota lichenized) from Mato Grosso do Sul, Brazil. Rodriguesia, 73: e02202020. doi: 10.1590/2175-7860202273034.

Paggi GM, Palma-Silva C, Zanella CM, Goetze M, Büttow MV, Lexer C, Bered F. 2022. Spatiotemporal variation of fertility, mating system and gene flow in Vriesea gigantea, an Atlantic Forest bromeliad. Frontiers in Forests and Global Change, 5: 893548. doi: 10.3389/ffgc.2022.893548.

Rodrigues AS, Costa PC, Lorenz AP, Jungbluth P. 2022. Hypotrachyna neohorrescens, a new species in the subgenus Parmelinopsis (Parmeliaceae) from Brazil. Lichenologist, 54(2): 107-115.

Vicente-Silva L, Faggioni GP, Paggi GM. 2022. Predicting potential distribution and evaluating biotic interactions of threatened species: a case study of Discocactus ferricola (Cactaceae). Biota Neotropica, 22(1): e20201145. doi: 10.1590/1676-0611-BN-2020-1145.